La hidrogeología es la ciencia que estudia las aguas subterráneas y ha sido reconocida relativamente en forma reciente por profesionales e instituciones dedicados al recurso hídrico. Aún más reciente, es la aceptación de que el agua subterránea y el agua superficial se encuentran íntimamente ligadas y deben ser estudiadas integralmente para poder preservar el recurso. Sin embargo, desde la antigüedad la relación del agua superficial y subterránea había sido reconocida por los pueblos precolombinos quienes hicieron un manejo integral y eficiente del recurso hídrico. Es conocido el trabajo hidráulico realizado por los incas, aztecas, mayas, zenúes y agustinianos, quienes fueron considerados ingenieros hábiles para construir eficientes sistemas de conducción, regulación de agua, riego en laderas de montaña, galerías filtrantes y drenaje del agua subterránea en montañas. Desafortunadamente el hombre actual (siglos XX y XXI) observa y sufre el deterioro y disminución de las fuentes de agua, sin tener una perspectiva alentadora. Se requiere estudio e investigación. Por otra parte, la experiencia en investigación del agua subterránea en zonas de montaña aporta criterios básicos para el uso de herramientas numéricas y el empleo de trazadores como los isótopos estables; plantea sugerencias y protocolos que contribuyan al desarrollo exitoso de programas de muestreos de aguas y explica cómo realizar análisis adecuados de calidad de datos para ser utilizados en la validación de hipótesis de flujos.